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l'Utilisation de Marqueurs Génétiques Polymorphes (Rapds) en Entomologie Évolutive et Appliquée

l'Utilisation de Marqueurs Génétiques Polymorphes (Rapds) en Entomologie Évolutive et Appliquée Résumé L'entomologie appliquée aussi bien que l'entomologie évolutive requièrent de plus en plus fréquemment l'usage de marqueurs moléculaires faciles à utiliser. Or, de nouvelles méthodes apparaissent qui pourraient bien réconcilier l'entomologie traditionnelle et les outils moléculaires. Cette revue a ainsi pour but de faire le point sur les limites et les avantages de l'utilisation de nouveaux marqueurs génétiques polymorphes, les RAPDs (Random Amplified Polymorphie DNAs) et sur leurs domaines d'application chez les insectes pour lesquels ils s'avèrent particulièrement bien appropriés. Le premier atout majeur de ces marqueurs RAPDs est la rapidité avec laquelle il est possible de les révéler en grand nombre sans que cela nécessite au préalable une quelconque information sur les séquences nucléotidiques des génomes étudiés. Ils sont générés lors d'une PCR (Polymerase Chain Reaction) initiée avec une seule amorçe de dix nucléotides générés au hasard. La très faible quantité d'ADN nécessaire à la réaction rend possible l'analyse individuelle d'insectes de très petite taille, voire d'un fragment d'insecte, ou un stade immature. Le second atout est leur haut niveau de polymorphisme, certains de ces marqueurs moléculaires étant situés dans des régions génomiques comportant des séquences d'ADN répétées. Cependant, comme tout marqueur, les RAPDs ont leurs limites d'utilisation tant méthodologiques que conceptuelles. Seules une mise au point rigoureuse des conditions de réaction et l'utilisation de conditions d'électrophorèse hautement résolutive assurent une bonne reproductibilité des marqueurs. De plus, l'homologie des fragments qui co-migrent doit être assurée. Il en résulte que leur domaine d'utilisation se limite aux espèces cryptiques, aux populations, aux biotypes et aux lignées clonales. Il n'est pas conseillé de les utiliser aux niveaux taxinomiques supérieurs. Les RAPDs trouvent de nombreuses applications en entomologie, comme l'attestent plus de soixante-dix publications déjà parues concernant sept ordres incluant 34 familles d'insectes. Par exemple, ces marqueurs sont utilisés pour la diagnose d'espèces affines ou cryptiques d'insectes d'importance agronomique ou médicale, ou pour l'étude de la structure génétique ou des systèmes de reproduction d'espèces, de populations ou de clones d'insectes spécialistes ou présentant des cycles de reproduction complexes. Ils permettent d'identifier la provenance de ravageurs immigrants; ils sont très utiles dans les études de recherche de paternité ou de parenté. D'une façon générale, les RAPDs constituent une alternative aux autres méthodes, isoenzymes, RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) lorsque ces dernières ne révèlent pas assez de polymorphisme pour être discriminatives. http://www.deepdyve.com/assets/images/DeepDyve-Logo-lg.png Annales de la Société entomologique de France (N S ) Taylor & Francis

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Publisher
Taylor & Francis
Copyright
© 1998 Société entomologique de France
ISSN
2168-6351
eISSN
0037-9271
DOI
10.1080/21686351.1998.12277758
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Abstract

Résumé L'entomologie appliquée aussi bien que l'entomologie évolutive requièrent de plus en plus fréquemment l'usage de marqueurs moléculaires faciles à utiliser. Or, de nouvelles méthodes apparaissent qui pourraient bien réconcilier l'entomologie traditionnelle et les outils moléculaires. Cette revue a ainsi pour but de faire le point sur les limites et les avantages de l'utilisation de nouveaux marqueurs génétiques polymorphes, les RAPDs (Random Amplified Polymorphie DNAs) et sur leurs domaines d'application chez les insectes pour lesquels ils s'avèrent particulièrement bien appropriés. Le premier atout majeur de ces marqueurs RAPDs est la rapidité avec laquelle il est possible de les révéler en grand nombre sans que cela nécessite au préalable une quelconque information sur les séquences nucléotidiques des génomes étudiés. Ils sont générés lors d'une PCR (Polymerase Chain Reaction) initiée avec une seule amorçe de dix nucléotides générés au hasard. La très faible quantité d'ADN nécessaire à la réaction rend possible l'analyse individuelle d'insectes de très petite taille, voire d'un fragment d'insecte, ou un stade immature. Le second atout est leur haut niveau de polymorphisme, certains de ces marqueurs moléculaires étant situés dans des régions génomiques comportant des séquences d'ADN répétées. Cependant, comme tout marqueur, les RAPDs ont leurs limites d'utilisation tant méthodologiques que conceptuelles. Seules une mise au point rigoureuse des conditions de réaction et l'utilisation de conditions d'électrophorèse hautement résolutive assurent une bonne reproductibilité des marqueurs. De plus, l'homologie des fragments qui co-migrent doit être assurée. Il en résulte que leur domaine d'utilisation se limite aux espèces cryptiques, aux populations, aux biotypes et aux lignées clonales. Il n'est pas conseillé de les utiliser aux niveaux taxinomiques supérieurs. Les RAPDs trouvent de nombreuses applications en entomologie, comme l'attestent plus de soixante-dix publications déjà parues concernant sept ordres incluant 34 familles d'insectes. Par exemple, ces marqueurs sont utilisés pour la diagnose d'espèces affines ou cryptiques d'insectes d'importance agronomique ou médicale, ou pour l'étude de la structure génétique ou des systèmes de reproduction d'espèces, de populations ou de clones d'insectes spécialistes ou présentant des cycles de reproduction complexes. Ils permettent d'identifier la provenance de ravageurs immigrants; ils sont très utiles dans les études de recherche de paternité ou de parenté. D'une façon générale, les RAPDs constituent une alternative aux autres méthodes, isoenzymes, RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) lorsque ces dernières ne révèlent pas assez de polymorphisme pour être discriminatives.

Journal

Annales de la Société entomologique de France (N S ) – Taylor & Francis

Published: Mar 31, 1998

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